动物科技分院党总支成立于2005年，下设现代畜牧党支部、动物医学工程党支部、特种养殖党支部、学生工作党支部4个教工党支部和1个学生党小组，根据大学生社区学生思想教育工作的需要还组建有1个师生社区党支部，在册教师党员35人、学生党员31人，2020年11月入选自治区首批高校党建标杆院系创建单位。
分院党总支全面贯彻落实党的十九大精神，以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观、习近平新时代中国特色社会主义思想理论为指导，坚持党的教育方针，贯彻党中央治疆方略，聚焦总目标，加强分院党的领导，加强分院党的组织建设和作风建设，紧紧围绕学院高等农业职业教育教学中心工作，扎实推进分院党建各项工作。改革创新，健全制度，狠抓落实，切实增强分院党的创造力、凝聚力、战斗力，使党的建设工作更富有时代气息、更富有实际成效，为办好让新疆各族人民满意的高等农业职业教育提供坚强的思想、政治和组织保障。
